per i dolori non so che dirti, mi sembra normale
per l'equilibrio ho lo stesso problema. lo perdo anche se i muscoli non sono affaticati piu di tanto e anche senza carichi eccessivi.

potrebbe semplicemente essere un problema propriocettivo, ovvero di corretta coordinazione muscolare (magari dovuta anche a squlibri tra gruppi o lati del corpo, per esempio io ho uno squlibrio a vantaggio della parte destra)

penso, ma è solo un'ipotesi, che continuando a fare affondi tu riesca a recuperare la corretta propriocettività e dunque migliorare l'equlibrio, focalizzandoti piu sull'esecuzione che sui carichi (non usarlo come es fondamentale, ma di complemento)

la ginnastica propriocettiva invece sono certo (avendola fatta spesso) che aiuta molto. detta in soldoni, significa ad esempio prendere una tavoletta basculante e metterla sotto i piedi, cercando di mantenere l'equlibrio il piu a lungo possibile (variando le posizioni e dunque cercando di recuperarlo). sembra una cosa stupida ma è piu ostica di quanto non sembri!