Non ne sono affatto certo, ma come indicazione di massima (dovuta ad una certa esperienza di voli aerei post 11/9), direi che mettere le proteine nella propria confezione originale, all'interno del bagaglio stivato non penso possa provocare problemi.

Poi occorrerebbe distinguere in viaggi nazionali e internazionali e, per questi ultimi, verso quale destinazione (ad esempio negli states gli alimenti sono vietati o alcuni di essi).

Nel bagaglio a mano, penso proprio che si possano verificare contrattempi. Magari non capita nulla (soprattutto in aeroporti tranquilli, cioè non a Malpensa o Fiumicino e in viaggi nazionali), ma è meglio prevenire problemi di qualunque natura.